تأسس قسم هندسة التعدين بكلية هندسة النفط والتعدين بجامعة السودان للعلوم والتكنولوجيا امتدادًا للتطور الأكاديمي والتوسع المنهجي في تخصصات الكلية الاستخراجية، والتي تحولت من مسمى "كلية هندسة وتكنولوجيا النفط" إلى مسمّاها الحالي لتعكس شمولية التخصصات النفطية والتعدينية. وقد جاء إنشاء هذا القسم استجابةً للنمو المضطرد في قطاع التعدين بالسودان والحاجة الماسّة لرفد هذا القطاع الحيوي بالكوادر الهندسية المؤهلة لإدارة واستغلال الثروات المعدنية الوطنية بطرق علمية واقتصادية متطورة. 

تتركز رسالة القسم في إعداد مهندسين واستشاريين كفؤين ومواكبين للتطوير التكنولوجي والمتطلبات الحديثة في مجالات استكشاف، وتعدين، وتجهيز الخامات المعدنية. ويهدف المنهج الأكاديمي إلى تزويد الطلاب بالخبرات العلمية والمهارات التطبيقية المتقدمة التي تلبي الاحتياجات الفعلية لسوق العمل والشركات العاملة في قطاع المعادن، مع التركيز على السلامة المهنية، وإدارة الموارد البيئية، وتطبيق دراسات الجدوى الاقتصادية للمشاريع التعدينية.

يقدم القسم برنامجاً أكاديمياً متكاملاً يمنح درجة بكالوريوس العلوم (شرف) في هندسة التعدين بنظام الساعات المعتمدة على مدى خمس سنوات دراسية (10 فصول دراسية). كما يُسهم أعضاء الهيئة التدريسية بالقسم بفاعلية في تقديم الاستشارات الفنية والإشراف الأكاديمي على برامج الدراسات العليا من ماجستير ودكتوراه في المجالات التعدينية والاستكشافية المتخصصة بالكلية.

تتنوع المقررات الدراسية بالقسم لتغطي محاور هندسية وتقنية متكاملة تضمن إعداد الخريج لمختلف مراحل العمل التعديني؛ حيث تشمل طرق تصميم وتنفيذ المناجم السطحية والسفلية (تحت الأرض)، وتقنيات الحفر والتفجير، وميكانيكا الصخور، إضافة إلى معالجة وتجهيز الخامات المعدنية وتصنيفها. كما يدرس الطلاب العلوم المساندة مثل الجيولوجيا التعدينية، ونظم المعلومات الجغرافية (GIS)، وتهوية المناجم، والسلامة والبيئة الهندسيين. ويكتمل هذا البناء الأكاديمي بإلزام الطلاب بإنجاز تدريب ميداني عملي مكثف في مواقع الشركات والمناجم، وتكلل ذلك بتقديم مشروع تخرج تطبيقي يطرح حلولاً هندسية لمشكلات ميدانية واقعية.