يُعد قسم تطبيقات الليزر الهندسية والصناعية أحد الأقسام الأكاديمية الرئيسة بمعهد الليزر، وقد أُنشئ بالتزامن مع تأسيس المعهد بهدف تطوير وتوظيف تقنيات الليزر في مختلف المجالات الهندسية والصناعية. ويهتم القسم بتطبيقات الليزر في الهندسة الكهربائية والإلكترونية، والاتصالات، والهندسة الميكانيكية، وهندسة المواد، والهندسة الكيميائية، بما يسهم في دعم البحث العلمي وتلبية احتياجات القطاعات الصناعية. أهداف القسم:يسعى القسم إلى إعداد كوادر هندسية مؤهلة تمتلك المعرفة والمهارات اللازمة لاستخدام تقنيات الليزر في التطبيقات الهندسية الحديثة، وتقديم الخدمات الاستشارية والحلول التقنية، إلى جانب تنظيم الندوات وورش العمل والمؤتمرات العلمية، وتشجيع البحث العلمي والابتكار في مجالات الاتصالات الضوئية، والمجسات، والتصوير المجسم، ومعالجة المواد والأسطح بالليزر، والبوليمرات، والفحص غير الإتلافي، وغيرها من التطبيقات المتقدمة.
ويضم القسم مجموعات بحثية متخصصة في الإلكترونيات البصرية والاتصالات، وهندسة المواد والتطبيقات الميكانيكية، يشرف عليها نخبة من المتخصصين في علوم الليزر والهندسة. كما يشتمل على معامل وورش متطورة تشمل معمل الاتصالات الضوئية، والورشة الميكانيكية، ومعمل ليزر ثاني أكسيد الكربون (CO₂)، بما يوفر بيئة علمية وبحثية متكاملة لدعم الدراسات العليا وتنفيذ المشاريع البحثية والتطبيقية.