تأسس قسم المعمار في 1970م وباشر أعماله في مدينة بورتسودان تحت اسم معهد الفنيين للهندسة المدنية والمعمار ، وانتقل القسم بعد ذلك الى العاصمة القومية تحت نفس الإسم وفي عام 1975م ثم تجميع مجموعة من المعاهد الفنية تحت مظلة معهد الكليات التكنولوجية والذي اصبح فيه قسم المعمار جزءاً من كلية الدراسات الهندسية والعلمية ، وكان يضم شعبتين انذاك هما شعبة للمباني وشعبة المعمار . في عام 1990م تم تحويل معهد الكليات التكنولوجية الى جامعة السودان للعلوم والتكنولوجيا وأصبحت تضم عدداً من الكليات من ضمنها كلية الهندسة والتي تمثل قسم المعمار أحد أقسامها ، وتم ادخال برنامج بكالوريوس المعمار عام 1995م . وتخرجت أول دفعة من حملة البكالوريوس في المعمار عام 2001 م . حالياً يمنح قسم العمارة درجة بكالوريوس الشرف في هندسة العمارة وينفذ برنامج الماجستير في العمارة في برامج التصميم المعماري ، خدمات المباني والتصميم الحضرى تحت مظلة كلية الدراسات العليا والبحث العلمي وبرنامجي الدبلوم التقني في العمارة والمباني بالتنسيق مع كلية التكنولوجيا وفي إطار سعي جامعة السودان للعلوم والتكنولوجيا لتجويد الأداء الأكاديمي ومواكبة التطور المتسارع في مختلف المجالات نبعت فكرة تقسيم كلية الهندسة إلى مدارس وتحويل قسم العمارة إلى كلية قائمة بذاتها حتى تتمكن من تلبية حاجة السوق لخلق تنوع في التخصصات في ظل النهضة العمرانية والتكنولوجية الكبيرة التي شهدتها البلاد في السنوات الأخيرة ، وقد اجيز المقترح في مجلس الأساتذة الموقر في جلسته رقم ( 99-1 / 2011 ) بتاريخ 10 ) فبراير . ( 2011 في عام 2014 م تمت اضافة واجازة برامج جديدة وهي برنامج التخطيط الحضري ويمنح درجة بكالوريوس الشرف في العمارة ( تخصص التخطيط الحضري ) وبرنامج تكنولوجيا العمارة ويمنح درجة بكالوريوس الشرف في العمارة ) تخصص تكنولوجيا العمارة ) وسوف يتم قبول اول دفعة فيهما العام الدراسي 2015-2014 م وسوف يتم تنفيذ بكالوريوس الشرف في تكنولوجيا العمارة بالتنسيق مع إدارة البكالوريوس التكنولوجي.